1. 斯坦福科學(xué)家在 GitHub 開(kāi)源了莫德納 mRNA 新冠疫苗的基因測(cè)序

        共 1914字,需瀏覽 4分鐘

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        2021-04-02 12:20

        轉(zhuǎn)自:機(jī)器之心

        在世界范圍內(nèi),RNA 疫苗已經(jīng)成為應(yīng)對(duì)疫情的關(guān)鍵工具。輝瑞、莫德納等生物科技公司也早早地推出了自己研發(fā)的新冠疫苗。隨著疫苗接種范圍的擴(kuò)大,這些疫苗中的 mRNA 正在成為人類世界中的新物種。因此,我們有必要加深對(duì)它們的了解。

        近日,斯坦福大學(xué)的幾位科學(xué)家在 GitHub 上公布了一份包含莫德納新冠疫苗 mRNA 序列的新文件,或有助于增加我們對(duì)該疫苗的了解。


        GitHub 鏈接:https://github.com/NAalytics/Assemblies-of-putative-SARS-CoV2-spike-encoding-mRNA-sequences-for-vaccines-BNT-162b2-and-mRNA-1273

        這份文件共有四頁(yè):前兩頁(yè)是幾位科學(xué)家對(duì)這項(xiàng)工作的解釋,后兩頁(yè)包含莫德納 COVID-19 疫苗的 mRNA 序列。


        幾位科學(xué)家表示,隨著疫苗的推廣,這些序列開(kāi)始在很多不同的調(diào)查、診斷性研究中出現(xiàn)。知道這些序列并有能力將其與其他 RNA 區(qū)分開(kāi),對(duì)于分析未來(lái)的生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)集是非常有用的。具體來(lái)說(shuō),它可以幫助研究者或臨床醫(yī)生在測(cè)序過(guò)程中快速判定該序列為治療性 mRNA 而非宿主或感染源。

        科學(xué)家們還在文件中披露了一些他們獲取樣本的細(xì)節(jié),「在這項(xiàng)工作中,RNA 是從免疫接種后殘留在小瓶中的小劑量疫苗中獲得的;這些殘留的疫苗本該被丟棄,只有獲得 FDA 的許可才能用來(lái)做研究?!巩?dāng)然,科學(xué)家們?cè)谧鲅芯恐澳玫搅?FDA 的許可。

        研究團(tuán)隊(duì)還表示,他們并沒(méi)有對(duì)疫苗進(jìn)行逆向工程,只是「公布了兩種合成 RNA 分子的假定序列,它們?cè)?2021 年的醫(yī)學(xué)和人體生物學(xué)大環(huán)境中已經(jīng)變得非常普遍」。

        他們說(shuō),文件發(fā)布之后,「任何有興趣」的人都可以在此序列的基礎(chǔ)上進(jìn)行數(shù)據(jù)挖掘和過(guò)濾。研究者可以以最快的速度獲得該序列,同時(shí)又不必猜測(cè)其來(lái)源,這其中包含龐大的經(jīng)濟(jì)價(jià)值和教育價(jià)值。

        在將文件上傳到 GitHub 之前,研究者聯(lián)系過(guò)莫德納,但對(duì)方?jīng)]有給出回應(yīng),也沒(méi)有反對(duì)他們發(fā)表。

        或許對(duì)于莫德納來(lái)說(shuō),這并不是一件大事兒,畢竟拿到序列和造出疫苗中間還有十萬(wàn)八千里。

        PowerDNS 的創(chuàng)始人 Bert Hubert 此前曾利用 BioNTech / 輝瑞疫苗的公開(kāi)信息推導(dǎo)出了其 mRNA 的序列。他在一篇博客中寫(xiě)道,「這并不意味著身處『分布式制造革命』中的任何人都能很快在家自制疫苗。」

        疫苗的整個(gè)生產(chǎn)供應(yīng)鏈非常復(fù)雜:DNA 和 mRNA 要在專門(mén)的設(shè)施中生產(chǎn),mRNA 要和脂質(zhì)合成脂質(zhì)納米粒(LNP),知道后者如何做的專家可能不到幾百人。即使是最后的幾個(gè)步驟(包括將 LNP 與其他更普通的成分混合并裝入小瓶)也需要專業(yè)知識(shí)和專門(mén)設(shè)備。

        一位 Hacker News 網(wǎng)友指出了疫苗制造的幾大挑戰(zhàn)。

        在美國(guó),一些立法者正呼吁暫停新冠疫苗的專利保護(hù),以確保更多的人盡早接種疫苗。但前 FDA 委員、輝瑞董事會(huì)成員 Scott Gottlieb 認(rèn)為,疫苗接種的真正瓶頸主要在于供應(yīng)和生產(chǎn),而不是知識(shí)產(chǎn)權(quán)限制。

        據(jù) CNBC 報(bào)道,白宮目前還在考慮是否要采納立法者暫停專利保護(hù)的建議。

        擴(kuò)展閱讀:科普好文 | 自然界也有源代碼:一位程序員「逆向工程」了輝瑞新冠疫苗 

        參考鏈接:
        https://www.vice.com/en/article/7k9gya/stanford-scientists-reverse-engineer-moderna-vaccine-post-code-on-github
        https://gizmodo.com/stanford-scientists-post-entire-mrna-sequence-for-moder-1846576268
        https://news.ycombinator.com/item?id=26628233


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