地名由來(lái)：南嶼鎮(zhèn)《榕城考古略》有“環(huán)山而居者曰南北嶼”的記載，這里的山指的是旗山。又述“渡合山橋，有爐峰石屹立于閽阓間者，曰南嶼。由錦溪橫貫境內(nèi)，北岸為北嶼（亦稱水西），南畔為南嶼”，故名。

2022年10月，2022年淘寶鎮(zhèn)名單發(fā)布，南嶼鎮(zhèn)上榜。

2022年12月，福建省愛(ài)國(guó)衛(wèi)生運(yùn)動(dòng)委員會(huì)命名南嶼鎮(zhèn)為2022年福建省衛(wèi)生鄉(xiāng)鎮(zhèn)。

2021年10月，南嶼鎮(zhèn)上榜2021年全國(guó)千強(qiáng)鎮(zhèn)名單，排名第204位。

2021年10月，南京大學(xué)空間規(guī)劃研究中心、阿里研究院聯(lián)合發(fā)布2021年淘寶鎮(zhèn)名單，南嶼鎮(zhèn)榜上有名。

2021年2月，福建省2018-2020年度省級(jí)文明村鎮(zhèn)社區(qū)名單出爐，南嶼鎮(zhèn)上榜。

2020年9月，阿里研究院公布2020年淘寶鎮(zhèn)，南嶼鎮(zhèn)榜上有名。

2014年9月，環(huán)境保護(hù)部授予南嶼鎮(zhèn)2012年—2013年度國(guó)家級(jí)生態(tài)鄉(xiāng)鎮(zhèn)稱號(hào)。

2012年1月，福建省人民政府認(rèn)定南嶼鎮(zhèn)為第四批福建省歷史文化名鎮(zhèn)名村。

南嶼鎮(zhèn)位于閩侯縣南部，旗山東麓，大樟溪西畔，東隔樟溪與南通鄉(xiāng)相望，東北與福州市南臺(tái)島相對(duì)，西南與永泰縣葛嶺塘前鄉(xiāng)接壤，北連上街鎮(zhèn)，面積170.5平方公里。下轄23個(gè)行政村、1個(gè)居民委員會(huì)，2000年計(jì)有16205戶，56305人。鎮(zhèn)政府駐地南旗村。

因錦溪橫貫境內(nèi)，南畔為南嶼而得名，北岸為北嶼（亦稱水西）。宋時(shí)分屬侯官縣修仁鄉(xiāng)海平里、靈鳳里、綏平里、遷蝗里，五芝鄉(xiāng)閩光里，三秀里，清政里、吉壤里，西孝悌鄉(xiāng)惠化里，揚(yáng)名里。元明屬三都、四都、五都、六都、七都、九都、十二都。清屬三都、四都、五都、六都、七都、九都、十一都。清末為南嶼區(qū)。民國(guó)29年分為鏡堯鄉(xiāng)、窗龍鄉(xiāng)、兩嶼鎮(zhèn)、芝峰鄉(xiāng)、浦口鄉(xiāng)，均屬第三區(qū)。民國(guó)34年為南嶼鄉(xiāng)，民國(guó)37年為南嶼鎮(zhèn)屬南嶼區(qū)。1949年9月后屬林森縣第五區(qū)，1956年南嶼區(qū)，1958年5月為南嶼鎮(zhèn)，9月改稱南嶼人民公社。1962年10月恢復(fù)區(qū)建制，1964年9月撤區(qū)并社，仍為南嶼人民公社。1984年7月撤公社，設(shè)立南嶼鎮(zhèn)。

旗山森林人家旅游區(qū)（旗山國(guó)家森林公園）

位于閩江南岸，閩侯縣的南嶼和上街兩鄉(xiāng)鎮(zhèn)間，又名翠旗山，海拔775米。由于其山勢(shì)逶迤似翠旗招展，故名。旗山佳景，以東麓為最。西北有石松寺，建于宋大中祥符三年（1010年），原名靈鳳寺。宋紹興十

水西林建筑群

水西林建筑群位于閩侯縣南嶼鎮(zhèn)南旗村水西林街，年代為明、清。簡(jiǎn)介：由明代進(jìn)士林春澤宅，其長(zhǎng)子明進(jìn)士林應(yīng)亮宅，次子林應(yīng)憲宅，長(zhǎng)孫林如楚宅及其后裔宅、旗峰林公祠等6處建筑組成，坐西向東，臨街排開(kāi)，

南嶼福壚寺

南嶼福壚寺位于閩侯縣南嶼鎮(zhèn)南旗村，年代為清。簡(jiǎn)介：俗稱泰山堂，明永樂(lè)年間(1403—1424)重建，清康熙六年(1667)擴(kuò)建，幾經(jīng)重修。坐西南向東北，依次建有木構(gòu)牌樓式門(mén)樓、戲臺(tái)、過(guò)雨亭、

旗峰林公祠

“旗峰林公祠”位于林春澤故居南側(cè)，始建于清康熙十一年（1672年），祀明程番知府林春澤、子林應(yīng)亮、孫如楚。為三進(jìn)院落，各進(jìn)均面闊三間，進(jìn)深五柱，穿斗扛梁式木構(gòu)架，歇山頂，建筑面積389平方米

林春澤宅

林春澤宅位于南嶼村水西林街，座西向東，背靠太平山，主座為三進(jìn)五開(kāi)間大宅。首進(jìn)為宮殿式門(mén)樓，位于中軸線上，單開(kāi)間帶八字墻，單檐歇山頂，左右各兩間倒座。門(mén)內(nèi)為天井，左右?guī)采?。第二進(jìn)為正廳，建筑

林應(yīng)亮故居

林應(yīng)亮故居林應(yīng)亮故居原為林春澤手建，嘉靖13年毀于大火。后林春澤長(zhǎng)子林應(yīng)亮在原址上重建。人稱林應(yīng)亮故居為“中衙”，是一座典型的明朝官家府第建筑。

歷史沿革：

宋太平興國(guó)六年（981年），侯官、閩縣析九鄉(xiāng)設(shè)置懷安縣。

明萬(wàn)歷八年（1580年），懷安縣并入侯官，南嶼均屬侯官縣治范圍。

民國(guó)二年（1913年），閩縣、侯官合并改稱閩侯縣，南嶼歸閩侯縣。

1951年，為閩侯縣第五區(qū)。

1956年，將南通、上街組合為南嶼區(qū)。

1958年，成立南嶼公社。

1984年10月，改為鎮(zhèn)。