circosPerl可視化圖形軟件包

Circos 是一個(gè)Perl語(yǔ)言開(kāi)發(fā)的自由可視化軟件，使用GPL協(xié)議分發(fā)，以繪制輸出圈圖(原型風(fēng)格的圖)為最大特色；最初主要用于基因組序列相關(guān)數(shù)據(jù)的可視化，目前已應(yīng)用于多個(gè)領(lǐng)域，例如 影視作品中的人物關(guān)系分析，物流公司的訂單來(lái)源和流向分析等，大多數(shù)關(guān)系型數(shù)據(jù)都可以嘗試用 circos來(lái)可視化。

Circos 是由加拿大的一位生物信息科學(xué)家 Martin Krzywinski 所開(kāi)發(fā)，他同時(shí)是一位專業(yè)攝影師，最初他主要從事Linux系統(tǒng)管理等工作。Circos 使用Perl語(yǔ)言開(kāi)發(fā)，所以可以安裝在任何支持Perl的操作系統(tǒng)上如linux, mac os, windows 等；Circos 主要使用Perl的GD庫(kù)來(lái)繪圖，可輸出PNG位圖或SVG矢量圖；Circos采用文本配置文件的方式來(lái)指定輸入輸出文件以及圖形樣式和繪圖規(guī)則等。

    Circos 英文的mail list 在 http://groups.google.com/group/circos-data-visualization，同時(shí)中文社區(qū)也很活躍，參考 http://code.google.com/p/circos-chn ，此處有一部分Circos中文相關(guān)的資料，同時(shí)有社區(qū)成員修改的circos版本供下載使用，以方便安裝和入門(mén)。

Circos 案例：

基因組數(shù)據(jù)的可視化

Linux內(nèi)核發(fā)展的可視化

影視作品人物關(guān)系的可視化