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        5個python高級可視化圖表!

        共 6387字,需瀏覽 13分鐘

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        2024-05-22 14:00



        大數(shù)據(jù)文摘受權(quán)轉(zhuǎn)載自數(shù)據(jù)分析及應(yīng)用

        1. 和弦圖(Chord Diagram)

        和弦圖,作為一種數(shù)據(jù)可視化工具,獨(dú)具匠心地展示了數(shù)據(jù)間的復(fù)雜關(guān)系。在圖表中,節(jié)點(diǎn)井然有序地分布于圓周之上,點(diǎn)與點(diǎn)之間則以優(yōu)雅的弧線相互連接,這些弧線不僅揭示了數(shù)據(jù)間的內(nèi)在聯(lián)系,還通過其長度的差異,直觀地反映了連接間的數(shù)值大小。更進(jìn)一步,弧線的粗細(xì)程度還巧妙地映射出數(shù)據(jù)間關(guān)系的重要性,使觀察者能一目了然地洞察數(shù)據(jù)背后的故事。


        此外,和弦圖還巧妙地運(yùn)用了色彩這一視覺元素,將數(shù)據(jù)分門別類,使得數(shù)據(jù)的比較和區(qū)分變得直觀且易于理解。這一特性使得和弦圖在多個領(lǐng)域都有著廣泛的應(yīng)用,特別是在生物科學(xué)領(lǐng)域,它成為了可視化基因數(shù)據(jù)的得力助手。在國際學(xué)術(shù)刊物上,和弦圖更是被譽(yù)為信息圖表(info graphics)的典范,用于揭示社交網(wǎng)絡(luò)的交織、基因組的奧秘、交通流的動態(tài)以及貿(mào)易關(guān)系的錯綜復(fù)雜。

        以下示例代碼使用Holoviews & Bokeh創(chuàng)建和弦圖,展示5個不同國家之間的貿(mào)易關(guān)系。

        import holoviews as hvfrom holoviews import optsimport pandas as pdimport numpy as nphv.extension('bokeh')
        # Sample matrix representing the export volumes between 5 countriesexport_data = np.array([[0, 50, 30, 20, 10], [10, 0, 40, 30, 20], [20, 10, 0, 35, 25], [30, 20, 10, 0, 40], [25, 15, 30, 20, 0]])
        labels = ['USA', 'China', 'Germany', 'Japan', 'India']
        # Creating a pandas DataFramedf = pd.DataFrame(export_data, index=labels, columns=labels)df = df.stack().reset_index()
        df.columns = ['source', 'target', 'value']
        # Creating a Chord objectchord = hv.Chord(df)
        # Styling the Chord diagramchord.opts( opts.Chord( cmap='Category20', edge_cmap='Category20', labels='source', label_text_font_size='10pt', edge_color='source', node_color='index', width=700, height=700 )).select(value=(5, None))
        # Display the plotchord

        https://holoviews.org/reference/elements/matplotlib/Chord.html

        https://github.com/moshi4/pyCirclize


        2. 旭日圖(Sunburst Chart)

        旭日圖(Sunburst Chart)以其獨(dú)特的視覺呈現(xiàn)方式,超越了傳統(tǒng)的餅圖和環(huán)圖,能夠清晰地表達(dá)數(shù)據(jù)的層級和歸屬關(guān)系。它通過父子層次結(jié)構(gòu)來展示數(shù)據(jù)的構(gòu)成情況,使用戶能夠輕松理解和分析復(fù)雜的層次數(shù)據(jù)。

        旭日圖由多個環(huán)形組成,每個環(huán)形都代表著層次結(jié)構(gòu)中的一個不同級別。圖表的中心是層次結(jié)構(gòu)的根或頂層,象征著數(shù)據(jù)的起點(diǎn)。每個環(huán)上的每個部分或扇區(qū)則代表著該層次結(jié)構(gòu)中的一個具體節(jié)點(diǎn),而每個部分/扇區(qū)的大小則與其在兄弟節(jié)點(diǎn)中的相對值成比例,直觀地反映了數(shù)據(jù)的重要性。

        旭日圖在多個領(lǐng)域中都展現(xiàn)出了其強(qiáng)大的數(shù)據(jù)可視化能力,如計(jì)算機(jī)文件系統(tǒng)的層級結(jié)構(gòu)、網(wǎng)站用戶的導(dǎo)航路徑、市場細(xì)分?jǐn)?shù)據(jù)的層級關(guān)系以及復(fù)雜的基因組數(shù)據(jù)等。這些應(yīng)用場景都通過旭日圖得以清晰、直觀地呈現(xiàn),幫助用戶快速理解數(shù)據(jù)的內(nèi)在結(jié)構(gòu)和邏輯關(guān)系。

        下面是一段使用Python庫Plotly繪制旭日圖的示例代碼,您可以通過這段代碼輕松創(chuàng)建出具有豐富層次結(jié)構(gòu)和數(shù)據(jù)信息的旭日圖。

        import plotly.express as pximport numpy as np
        df = px.data.gapminder().query("year == 2007")
        fig = px.sunburst(df, path=['continent', 'country'], values='pop', color='lifeExp', hover_data=['iso_alpha'], color_continuous_scale='RdBu', color_continuous_midpoint=np.average(df['lifeExp'], weights=df['pop']))fig.show()


        https://plotly.com/python/sunburst-charts/

        3. 六邊形箱圖(Hexbin Plot)

        六邊形箱圖(通常稱為六邊形分箱圖或六邊形熱力圖)是一種非常有效的可視化工具,用于展示二維數(shù)據(jù)分布,尤其是在數(shù)據(jù)點(diǎn)過于密集而導(dǎo)致傳統(tǒng)散點(diǎn)圖難以區(qū)分單個點(diǎn)的情況下。這種方法將數(shù)據(jù)空間劃分為一系列六邊形單元(或“箱”),并根據(jù)每個單元中的數(shù)據(jù)點(diǎn)數(shù)量進(jìn)行著色,從而提供了數(shù)據(jù)分布情況的直觀表示。


        以下是一個使用Python和Matplotlib庫創(chuàng)建六邊形分箱圖的示例,旨在揭示空氣質(zhì)量惡化(使用空氣質(zhì)量指數(shù)/AQI)與增加的醫(yī)院就診之間的潛在相關(guān)性。請注意,為了簡化示例,我們將使用模擬數(shù)據(jù)。

        import numpy as np  import matplotlib.pyplot as plt  from mplhexbin import HexBin  
        # 假設(shè)的模擬數(shù)據(jù) np.random.seed(0) # 確保結(jié)果可復(fù)現(xiàn) n_points = 10000 x = np.random.rand(n_points) * 100 # 空氣質(zhì)量指數(shù)(AQI)范圍從0到100 y = 5 * np.sin(x * np.pi / 50) + np.random.randn(n_points) * 15 # 假設(shè)的醫(yī)院就診數(shù)量,與AQI相關(guān)但具有噪聲
        # 創(chuàng)建一個新的圖形 fig, ax = plt.subplots(figsize=(10, 8))
        # 使用HexBin創(chuàng)建六邊形分箱圖 hb = HexBin(ax, gridsize=20, cmap='viridis', extent=[0, 100, -30, 50]) # 設(shè)置網(wǎng)格大小、顏色映射和范圍 hb.hexbin(x, y, mincnt=1) # 繪制六邊形分箱圖,mincnt設(shè)置最小計(jì)數(shù)閾值
        # 添加標(biāo)題和軸標(biāo)簽 ax.set_title('空氣質(zhì)量指數(shù)(AQI)與醫(yī)院就診數(shù)量的關(guān)系') ax.set_xlabel('空氣質(zhì)量指數(shù)(AQI)') ax.set_ylabel('醫(yī)院就診數(shù)量')
        # 顯示圖形 plt.colorbar(hb.cmap, ax=ax, label='數(shù)據(jù)點(diǎn)數(shù)量') # 添加顏色條并設(shè)置標(biāo)簽 plt.show()

        https://matplotlib.org/stable/gallery/statistics/hexbin_demo.html


        4. 桑基圖(Sankey Diagram)

        桑基圖(Sankey Diagram),也被稱為?;芰糠至鲌D或?;芰科胶鈭D,是一種特殊類型的流程圖,特別適用于展示能源、材料成分、金融等領(lǐng)域中數(shù)據(jù)流量的可視化分析。這一圖表類型的命名源于1898年Matthew Henry Phineas Riall Sankey所繪制的“蒸汽機(jī)的能源效率圖”,該圖因其直觀展示能量流動的方式而廣受贊譽(yù),并因此得名“桑基圖”。

        桑基圖通過節(jié)點(diǎn)和它們之間的鏈接來表示系統(tǒng)不同階段或部分之間數(shù)量的流動。節(jié)點(diǎn)通常表示系統(tǒng)中的不同部分或階段,而鏈接則表示這些部分或階段之間的流動關(guān)系。最為獨(dú)特的是,?;鶊D中鏈接的寬度直接與流動的數(shù)量成比例,使得數(shù)據(jù)的規(guī)模和流向一目了然。

        通過這種直觀的數(shù)據(jù)可視化方式,?;鶊D可以幫助用戶更好地理解系統(tǒng)中各部分之間的能量、物質(zhì)或資金的流動情況,從而有助于做出更明智的決策。在能源、材料科學(xué)、經(jīng)濟(jì)學(xué)和金融學(xué)等領(lǐng)域,?;鶊D已經(jīng)成為一種不可或缺的數(shù)據(jù)分析工具。

        Plotly庫可以用來創(chuàng)建如下所示的?;鶊D。以下代碼表示能量從生產(chǎn)源流向小城市的消費(fèi)者。

        import plotly.graph_objects as go
        labels = ["Coal", "Solar", "Wind", "Nuclear", "Residential", "Industrial", "Commercial"]
        source = [0, 1, 2, 3, 0, 1, 2, 3] target = [4, 4, 4, 4, 5, 5, 5, 5] value = [25, 10, 40, 20, 30, 15, 25, 35]
        # Create the Sankey diagram objectfig = go.Figure(data=[go.Sankey( node=dict( pad=15, thickness=20, line=dict(color="black", width=0.5), label=labels ), link=dict( source=source, target=target, value=value ))])
        fig.update_layout(title_text="Energy Flow in Model City", font_size=12)fig.show()


        https://plotly.com/python/sankey-diagram/


        5. 主題河流圖(Stream Graph/ Theme River)

        主題河流圖,顧名思義,其形態(tài)宛如自然界的河流,實(shí)際上它是一種獨(dú)具匠心的流圖設(shè)計(jì)。這種圖表主要用于描繪事件或主題隨時間而發(fā)生的動態(tài)變化。河流圖中,不同的顏色巧妙地區(qū)分了各個類別,或用以展示每個類別的附加定量信息。而河流的流向則與橫貫圖表的X軸平行,清晰映射出時間的流逝。

        更為精妙的是,每個類別的數(shù)值大小通過“河流”的寬度來直觀展現(xiàn)。當(dāng)某一類別的數(shù)值增大時,其對應(yīng)的河流部分便會拓寬;而當(dāng)數(shù)值減小,河流則相應(yīng)地變窄。這種變化使得整個圖表仿佛是由無數(shù)條寬窄不一的河流匯集、交織而成,從而得名“主題河流圖”。這種設(shè)計(jì)不僅富有美感,更能讓觀察者一目了然地掌握數(shù)據(jù)的變化趨勢和相互關(guān)系。

        Altair數(shù)據(jù)可視化庫可用于繪制流圖,如下所示。

        import altair as altfrom vega_datasets import data
        source = data.unemployment_across_industries.url
        alt.Chart(source).mark_area().encode( alt.X('yearmonth(date):T', axis=alt.Axis(format='%Y', domain=False, tickSize=0) ), alt.Y('sum(count):Q', stack='center', axis=None), alt.Color('series:N', scale=alt.Scale(scheme='category20b') )).interactive()


        https://altair-viz.github.io/gallery/streamgraph.html


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